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L’intelligenza artificiale individua nel DNA spazzatura fattori nascosti del cancro

Luca D'Angelo di Luca D'Angelo
04 Ago 2024 - 16:14
in Magazine
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(TEMPOITALIA.IT) La ricerca ⁢condotta dal Garvan Institute of⁣ Medical Research ha rivelato che il DNA non​ codificante, che costituisce il 98% del nostro genoma e in passato era considerato “spazzatura”, ‍potrebbe svolgere un ruolo cruciale nella diagnosi e nel⁤ trattamento del cancro. Lo studio ha individuato mutazioni in queste regioni legate a‍ 12 diversi tipi di cancro. Queste⁢ mutazioni si verificano ‍nei​ siti di legame per la proteina CTCF, essenziali per mantenere la struttura tridimensionale del ⁣genoma. ​Le ‍alterazioni in‌ questi​ siti potrebbero contribuire⁣ allo sviluppo ⁢del ‍cancro. I risultati suggeriscono un approccio potenzialmente ⁤universale al trattamento del cancro che mira⁢ a queste mutazioni comuni in vari tipi di tumori.

 

Secondo uno studio recente del Garvan Institute of Medical Research, ⁣il DNA non codificante potrebbe essere la chiave per nuove diagnosi e trattamenti del cancro. I risultati, pubblicati sulla rivista Nucleic ⁤Acids Research, rivelano mutazioni in regioni del ⁢genoma precedentemente ⁤trascurate che potrebbero contribuire alla formazione e alla progressione ⁢di almeno 12 diversi ⁢tipi di‌ cancro, ⁣tra cui il cancro ‌alla prostata, al seno e al colon-retto.⁣ Questa scoperta ⁣potrebbe portare a diagnosi precoci e a nuovi trattamenti efficaci‍ per molti tipi di cancro.

 

I ricercatori si⁤ sono concentrati su ⁤mutazioni che influenzano i siti di ‍legame per una proteina chiamata ‍ CTCF, che aiuta a piegare lunghi filamenti⁤ di DNA ​in ⁢forme specifiche. Nel loro ⁢lavoro precedente, avevano ⁣scoperto che questi siti di legame avvicinano parti ‌distanti ‍del DNA,⁤ formando strutture tridimensionali che controllano quali geni vengono attivati o disattivati. Per testare questa ipotesi, i ricercatori hanno sviluppato un nuovo strumento sofisticato di apprendimento automatico (AI) chiamato CTCF-INSITE, ⁢che ha utilizzato caratteristiche genomiche ⁤ed‌ epigenomiche per prevedere⁤ quali siti CTCF sono‍ probabilmente ancore‍ persistenti in‌ un‍ totale di 12 tipi di cancro. Hanno poi‍ valutato più di 3000 ‌campioni di tumori da ‌pazienti diagnosticati con i 12 tipi di‍ cancro, disponibili dal⁣ database dell’International Genome Consortium, e hanno trovato che ⁤le ancore persistenti erano ricche di mutazioni.

 

I‌ risultati potrebbero avere ampie implicazioni⁣ per la comprensione e il trattamento di molti tipi​ di cancro. I ricercatori⁤ stanno ora pianificando ulteriori ⁣esperimenti su larga scala utilizzando l’editing genetico CRISPR per ‍investigare come queste mutazioni delle ancore interrompono il genoma⁣ tridimensionale ‍e potenzialmente promuovono la crescita del ⁢cancro. (TEMPOITALIA.IT)

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